El Colegio Menor de Agustinos Calzados o de San Agustín fue fundado por orden de doña Juana de Austria, fundadora de las Descalzas Reales de Madrid, quien lo puso bajo el real patronato de su hermano, el rey Felipe II.

El Colegio Menor de San Patricio, más conocido como "de los Irlandeses" fue fundado, en 1645, para estudiantes de Teología de Irlanda, Flandes y Holanda.